土壤的組成大致分為三部分：礦物質、有機質和微生物，其中土壤微生物的活性是影響植物根部營養(yǎng)的重要因素。土壤中的有益微生物直接參與土壤肥力的形成，包括物質和能量的轉化、腐殖質的形成和分解、養(yǎng)分的釋放、氮素的固定等等。但隨著社會經(jīng)濟發(fā)展，各種化學肥料和農(nóng)藥的大量施用已嚴重破壞土壤微生態(tài)平衡，自然狀態(tài)下有益微生物數(shù)量不夠，作用力也有限。因此，人為向土壤中增加有益微生物數(shù)量，就能夠增強土壤中微生物的數(shù)量和整體活性，從而明顯提高土壤的肥力。

    微生物菌肥是一種生物肥，無論是大田作物、經(jīng)濟作物還是藥材、花卉等，效果明顯，這主要是因為功能微生物起到了關鍵性的作用。品質過硬的菌肥，如酵素菌肥，不僅含有大量固氮、解磷、解鉀活性菌，還含有腐殖酸和微量元素等，不僅可以改良土壤結構，消除土壤板結，還可以改善作物品質等。

    微生物肥料又不同于一般肥料，因其微生物菌種的特殊性，因此施用時應注意以下幾點：